Selain itu WinSCP juga menawarkan sebuah fitur file manager dan fungsi sinkronisasi file. Untuk transfer secara aman, WinSCP juga dapat digunakan untuk terhubung dengan menggunakan Secure Shell (SSH) dan mendukung protokol SCP dan SFTP.
Pengembangan WinSCP dimulai sekitar bulan Mei 2000 dan terus berlanjut. Awalnya diselenggarakan oleh Universitas Ekonomi di Praha, sejak tanggal 16 Juli 2003 berlisensi di bawah GNU GPL dan dipublikasikan melalui SourceForge.net.
WinSCP menjadi salah satu perangkat lunak FTP favorit karena fiturnya yang meliputi FTP dan dapat terhubung atau sudah mendukung protokol SSH, seperti Filezilla sebagai software FTP dan PuTTY yang biasanya digunakan untuk mengakses protokol SSH.
